GEEKNOME FastQC Report - Modelo con Datos
Visual fusionado GBSBIO + FastQC + AI Quality Assessment
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🤖 Informe de Calidad (AI Assessment)
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📊 Lecturas Totales
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✅ Lecturas Escritas
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🧬 Bases Totales
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⚙️ GC %
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⚠️ N %
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🎯 Q Media Estimada
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🧾 Resumen de Procesamiento
Métricas de paso, descarte y recorte generadas por el pipeline nativo.
Lecturas de entrada
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Lecturas retenidas
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Lecturas descartadas
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Retención
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Longitud media
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Calidad media global
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Filtro N
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Baja complejidad
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% N sobre bases
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Min / Moda / Max longitud
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Adapter trim total
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Poly-G / Head / SW
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| Adaptador | Recortes |
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📈 Per Base Sequence Quality
Promedio Phred por posicion. Bandas aproximadas de control FastQC.
📋 Module Summary
Resumen estimado tipo FastQC (PASS/WARN/FAIL).
| Modulo | Estado | Detalle |
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📊 Per Sequence Quality Scores
Distribucion de calidad media por read.
🧬 Per Sequence GC Content
Conteo por porcentaje GC (0..100).
📏 Sequence Length Distribution
Frecuencia por longitud de read.
🧬 Per Base Sequence Content
Composicion global A/C/G/T/N.
📊 Conteo de Bases
Tabla numerica para auditoria rapida.
| Base | Cantidad | Proporcion |
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🧬 Per Base Sequence Content
Composición A/T/G/C/N por posición (%). Primers 16S generan sesgo esperado en las primeras ~20 bases.
Adapter Content
Adaptadores Illumina detectados por posición. TruSeq · Nextera · small RNA. PASS <5%, WARN <20%, FAIL ≥20%.
📊 Sequence Duplication Levels
Estimación sobre primeros 200 000 reads. PASS >70% únicos, WARN >50%, FAIL ≤50%.
🔍 Calidad por Posicion (top 40)
Muestra resumida para inspeccion detallada.
| Posicion | Phred medio | N | Estado |
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Template: GBSBIO FastQC Enhanced + AI Assessment